Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Ifitm3Q9CQW9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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Ifitm3Q9CQW9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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Ifitm3Q9CQW9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Ifitm3Q9CQW9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Ifitm3Q9CQW9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Ifitm3Q9CQW9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Ifitm3Q9CQW9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Ifitm3Q9CQW9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ifitm3Q9CQW9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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