Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms