Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl20Q9CQL4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl20Q9CQL4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl20Q9CQL4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms