Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DenrQ9CQJ6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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