Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpb2Q9CQI7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snrpb2Q9CQI7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms