Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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