Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pole4Q9CQ36 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole4Q9CQ36 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms