Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn6Q99PL6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubxn6Q99PL6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms