Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh8Q99NA2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms