Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnpo2Q99LG2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms