Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lactb2Q99KR3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms