Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Prpf19Q99KP6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Prpf19Q99KP6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prpf19Q99KP6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Prpf19Q99KP6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Prpf19Q99KP6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Prpf19Q99KP6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Prpf19Q99KP6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Prpf19Q99KP6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prpf19Q99KP6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prpf19Q99KP6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prpf19Q99KP6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prpf19Q99KP6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms