Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab28Q99KL7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms