Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ophn1Q99J31 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms