Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msi2Q920Q6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms