Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l1Q920A7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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