Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atl3Q91YH5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms