Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK0

Tmem30a, Cell cycle control protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30aQ8VEK0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem30aQ8VEK0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms