Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vps4aQ8VEJ9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms