Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Stx18Q8VDS8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Stx18Q8VDS8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Stx18Q8VDS8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Stx18Q8VDS8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Stx18Q8VDS8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Stx18Q8VDS8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx18Q8VDS8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms