Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VDP2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8VDP2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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