Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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