Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC90

Zdhhc12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdhhc12Q8VC90 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zdhhc12Q8VC90 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zdhhc12Q8VC90 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zdhhc12Q8VC90 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zdhhc12Q8VC90 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zdhhc12Q8VC90 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zdhhc12Q8VC90 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zdhhc12Q8VC90 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zdhhc12Q8VC90 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zdhhc12Q8VC90 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zdhhc12Q8VC90 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zdhhc12Q8VC90 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zdhhc12Q8VC90 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zdhhc12Q8VC90 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zdhhc12Q8VC90 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms