Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Impg1Q8R1W8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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