Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms