Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxc12Q8K5B8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxc12Q8K5B8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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