Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml1Q8K558 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms