Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsl1Q8K305 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms