Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccm2Q8K2Y9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms