Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcf3Q8K268 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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