Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1eQ8K202 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr1eQ8K202 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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