Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG8

Prmt5, Protein arginine N-methyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt5Q8CIG8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prmt5Q8CIG8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prmt5Q8CIG8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms