Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup88Q8CEC0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 552.4 ms