Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc9Q8CDN9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc9Q8CDN9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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