Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Lrif1Q8CDD9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrif1Q8CDD9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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