Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A430089I19RikQ8C9W1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A430089I19RikQ8C9W1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms