Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
4930507D05RikQ8C9C9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms