Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms