Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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