Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms