Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms