Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Efemp1Q8BPB5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms