Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Grik4Q8BMF5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik4Q8BMF5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms