Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smoc1Q8BLY1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms