Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms