Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms