Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJF9

Chmp2b, Charged multivesicular body protein 2b, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2bQ8BJF9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp2bQ8BJF9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp2bQ8BJF9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms