Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms