Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prox2Q8BII1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox2Q8BII1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox2Q8BII1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox2Q8BII1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox2Q8BII1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox2Q8BII1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox2Q8BII1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox2Q8BII1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox2Q8BII1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms