Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8BGC1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8BGC1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8BGC1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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